DNA Barcoding Tanaman Mangga Kasturi (Mangifera casturi) Asal Kalimantan Selatan Berbasis DNA Kloroplas Gen rbcL dan matK

Penulis

  • Sogandi Sogandi University of 17 Agustus 1945 Jakarta
  • Zuraida Sagala Fakultas Farmasi, Universitas 17 Agustus 1945 ,

DOI:

https://doi.org/10.35814/jifi.v20i1.1045

Kata Kunci:

DNA barcoding, filogenetik, genetik, kasturi, Mangifera

Abstrak

Penelitian ini bertujuan untuk melihat keragaman genetik tanaman mangga kasturi (Mangifera casturi) di Kalimantan Selatan menggunakan sekuens dari gen rbcL dan gen matK. Sampel tumbuhan yang digunakan dalam penelitian ini adalah daun mangga kasturi (Mangifera casturi) yang diambil dari delapan kabupaten dan kota di Provinsi Kalimantan Selatan yaitu dari Kota Amuntai, Astambul, Barito Kuala, Gambut, Kandanga, Babirik, Tabalong, dan Tanah Laut. Isolasi dan analisis DNA tanaman mangga kasturi dilakukan di laboratorium penelitian Fakultas Bioteknologi Universitas Katolik Indonesia Atma Jaya, Jakarta. Analisis keragaman genetik mangga kasturi dimulai dengan tahap amplifikasi DNA genom (gDNA) menggunakan primer rbcL dan matK. Hasil isolasi DNA sampel menunjukkan konsentrasi yang tinggi yaitu 17-91 ng/µL dengan kemurnian berkisar antara 1,72-1,92 ng/µL. Pada saat PCR dilakukan dengan primer rbcL dan matK, dari 8 wilayah di Kalimantan Selatan, terdapat 5 sampel (Babirik, Tabalong, Kandangan, Amuntai, Batola, Gambut, dan Tanah Laut) dapat teramplifikasi menggunakan primer rbcL dan 6 sampel (Tanah Laut, Babirik, Tabalong, Amuntai, Gambut, dan Kandangan) teramplifikasi menggunakan primer matK. Hubungan antara mangga kasturi di Kalimantan Selatan dapat dilihat dari pohon filogenetiknya.

Referensi

Unduhan

Diterbitkan

2022-04-27

Terbitan

Vol 20 No 1 (2022): JIFI

Bagian

Articles

Lisensi

Licencing
All articles in Jurnal Ilmu Kefarmasian Indonesia are an open-access article, distributed under the terms of the Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License which permits unrestricted non-commercial used, distribution and reproduction in any medium.

This licence applies to Author(s) and Public Reader means that the users mays :

  • SHARE:
    copy and redistribute the article in any medium or format
  • ADAPT:
    remix, transform, and build upon the article (eg.: to produce a new research work and, possibly, a new publication)
  • ALIKE:
    If you remix, transform, or build upon the article, you must distribute your contributions under the same license as the original.
  • NO ADDITIONAL RESTRICTIONS:
    You may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits.

It does however mean that when you use it you must:

  • ATTRIBUTION: You must give appropriate credit to both the Author(s) and the journal, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use.

You may not:

  • NONCOMMERCIAL: You may not use the article for commercial purposes.

Creative Commons License

This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License.